Darling-perheellä on kolme sää lasta. Vanhin on Wendy, sitten tulee John ja sitten Michael. Heillä on epätavallinen lastenhoitaja - iso musta sukeltajakoira nimeltä Nena. Eräänä iltana menossa makuuhuoneeseen lasten kanssa jo sängyssä, rouva Darling näkee pojan lentävän ikkunaan, ja hänen jälkeensä - omituisen valoisan paikan. Hän huutaa yllätyksenä, Nan juoksee huutaa. Pojalla onnistuu räpätä ikkunasta, mutta Nenan hampaissa hänen varjo pysyy! Rouva Darling kääntää sen ylös ja laittaa lipastoon.
Muutamaa päivää myöhemmin rouva ja herra Darling aikovat käydä. Kiireessä, herra Darling törmää Nenaan, ja housuissaan - se on ongelma! - turkki jää. Herra Darling ajaa Nenan pihalle ja laittaa ketjun. Heti kun vanhemmat poistuvat talosta, pieni valo lentää lapsille - tämä on Tinker Bell -keiju, hän etsii varjoa. Hänen seurauksena ilmestyy Peter Pan. Tinker Bell -merkin kautta (keiju ei osaa puhua, hän soi melodisen soiton) Peter löytää varjon ja yrittää kiinnittää sen takaisin, mutta mitään ei tule esiin. Peter alkaa itkeä, ja hänen sopansa herättävät Wendyn. Saatuaan tietää mitä tapahtui, Wendy ompelee varjon Peterin korkoille. Se satuttaa vähän, mutta hän kärsii. Tunteessaan luottamusta Wendyyn, Peter kertoo hänelle itsestään: hän pakeni kotoaan päättäessään koskaan tulla aikuiseksi.Hän asuu Netinebudin saarella kadonneiden poikien kanssa ("kun lapsi putoaa lastenrattaasta, hän menee Netinebudin maahan"). Samaan aikaan jotain käy ilmi keijuista: käy ilmi, että keijut syntyvät lasten naurusta ja jokaisella lapsella on oma keijunsa. Mutta heti kun joku ajattelee "tyhmää, maailmassa ei ole keijuja" - ja keiju kuolee.
Saatuaan tietää, että Wendy osaa kertoa tarinoita, Peter kutsuu Wendyn saarelle (”Minä opetan sinut lentämään, ja me lennämme yhdessä”) niin, että hän kertoo satuja ja on kaikkien kadonneiden poikien äiti. Wendy epäröi, mutta on silti samaa mieltä. John ja Michael lentävät hänen kanssaan.
Saaren asukkaat valmistautuvat tapaamaan Pietaria. Pojat etsivät paikkaa, jonne Pietari laskeutuu. Kapteeni Jez Hookin johtamat merirosvot etsivät poikia, punaiset nahat (heidän johtajanaan on pieni pieni pantteri) etsivät merirosvoja, ja villieläimet etsivät punaisia nahkaa niiden syömiseksi.
Estä Wendyn saapuminen, keiju Tinker Bell ilmestyy. Hän (kateellisuudesta!) Peterin puolesta käskee pojat ampumaan Wendyn keulalla. Heillä ei ole syytä epäillä, ja yksi heistä ampuu. Wendy putoaa maahan ja on kuollut. Mutta hän ei kuollut, hänet pelasti kaulan ympärillä roikkuva tammenterho, Peter Panin lahja ja nuoli lävisti hänet. Mutta Wendy on hyvin heikko, ja kaikki pojat lähestyvän Pietarin johdolla rakentavat hänelle talon ja pystyivät sen ympärilleen. Talo osoittautuu aika hyvältä. Wendy harjoittaa vakavasti tehtäviään: hän kokkii, pyyhkii, darnoi ja tietysti kertoi satuja.
Merirosvot eivät jätä poikia yksin. Kapteeni Hook - hänen nimensä on ollut siitä lähtien, kun Pietari katkaisi kätensä, sen sijaan että hänen oli kiinnitettävä rautakoukku - Pietari ei voi antaa sitä anteeksi, varsinkin kun krokotiili nielaisi kätensä niin paljon, että hän piti siitä niin paljon, että hän metsästää koukkua On hyvä, että kuulet sen napsauttamalla kapteenin rannekelloa, joka ei estänyt kävelemään krokotiilin vatsassa. Kapteeni keksi idean leipoa myrkytetty kakku poikien kuolemiseksi, mutta hän ei onnistu saavuttamaan mitään tällä tavoin - Wendy ei anna heidän syödä makeisia, ja kakku pysyy turvallisesti niityllä, kunnes kapteeni kompastuu pimeässä ja putoaa maahan. Eräänä päivänä merirosvot haluavat sitoa intialaisen prinsessatiikerin Lilyn laguunissa olevaan kallioon upottaakseen sen vuoroveden kanssa. Peter Pan onnistuu pettämään merirosvot määräämällä heidät (kapteeni Hookin äänellä) vapauttamaan hänet. Sitten Pietarin on taisteltava Hookin kanssa, ja hän haavoittaa hänet. Peter pelastaa linnun.
Eräänä iltana Wendy kertoo pojille heidän suosikki sadunsa - siitä, kuinka yksi herrasmies ja yksi nainen asuivat, jolloin lapset lentivät eräänä päivänä Netinebudin saarelle. Ja kuinka he pitivät ikkunan auki, jotta lapset voivat lentää kotiin.
Peter vastustaa Wendyä: hän oli aikaisemmin ajatellut myös sellaisista äideistä, joten hän ei kiirehti paluutaan. Ja kun hän saapui, ikkuna oli suljettu, ja toinen poika nukkui sängyssään.
Sitten John ja Michael, Wendy-veljet, ymmärtävät, että heidän on kiirehdyttävä kotiin.Wendy soittaa myös muiden poikien kanssa, luottaen siihen, että hänen vanhempansa varmasti adoptoivat heidät. Kaikki ovat yhtä mieltä paitsi Peter Pan, joka ei halua tulla isoksi. Peter pyytää intialaisia näkemään Wendyn ja pojat, mutta merirosvot puhuvat taas. He onnistuvat voittamaan intialaiset epärehellisillä tavoilla ja vangitsemaan Wendyn ja pojat. Peter oppii tästä Tinker Belliltä ja kiirehtii apua. Peter Panin ja kapteeni Hookin välillä on ratkaiseva taistelu. Merirosvot voitetaan. Pojat ja Wendy lentävät kotiin.
Samaan aikaan Lontoossa rouva ja herra Darling odottavat edelleen lapsia eivätkä koskaan sulje lastentarhan ikkunoita. Ja herra Darling ei voi antaa anteeksi itselleen siitä, ettei hän potkenut Nanua ulos talosta sinä kauheana iltana ja pannut hänet ketjuun. Siksi hän lupasi, kunnes lapset palasivat elämään koiratalossa, hänet vietiin siihen työskentelemään ja tuotiin kotiin töistä. Rouva Darling istuu pianon vieressä ja alkaa soittaa. Tällä hetkellä Peter ja Tinker Bell saapuvat. He sulkevat ikkunan niin, että Wendy päättää, että äiti ei enää odota häntä eikä rakasta häntä ja palaa Peterin kanssa saarelle. Mutta musiikin soinnissa on suurta surua, ja Peter avaa ikkunan uudelleen. Wendy, John ja Michael lentävät ikkunassa ja kiivetä sänkyyn. Äiti löytää heidät, vaatii isäänsä ja Nana juoksee myös huoneeseen. Kaikki ovat iloisia. Ja pojat odottavat alla, kun taas Wendy kertoo vanhemmilleen heistä. Laskettuaan viiteen tuhanteen, he tulevat taloon ja riviin rouva Darlingin eteen. Tietenkin, sekä rouva että herra Darling päättivät adoptoida heidät! Peter lentää taas saarelle. Hän lupaa Wendyn lentävän ensi vuonna, mutta unohtaa sen.Ja kun Peter ilmestyy uudelleen, Wendy on jo naimisissa ja hänellä on pieni tytär Jane.
Huomaamatta muutoksia, Peter kutsuu Wendyn mukaan, mutta hän kieltäytyy huokaisemasta, koska hän on jo aikuinen. Wendy poistuu huoneesta rauhoittua. Peter Pan istuu lattialla ja itkee. Hänen sohkansa herättävät Jane.
Ja kaikki toistuu uudestaan.
Kun Jane kasvaa, syntyy tyttärensä Margaret ja nyt Margaret lentää Peter Panin kanssa Netinebudin saarelle ... Ja tämä jatkuu, kunnes lapset lakkaavat olemasta niin iloisia, käsittämättömiä ja sydämettömiä.