: Rohkea velhopoika kohtaa tumman taikurin, vanhempiensa tappajan, ja pyrkii kaikin tavoin, jotta konna ei saisi filosofin kiveä: vanhempien kuoleman ei pitäisi olla turhaa.
Dursley vihaa kaikkea epätavallista. Mutta jonain päivänä outoja ihmisiä, vaaleita vaatteita, alkoi kävellä kaduilla ja keskustella Dursley-veljenpojasta - yksivuotisesta Harry Potterista. Yöllä velhoja ilmestyy lähellä Dursley-taloa: professori Dumbledore, Tylypahkan taikuuskoulun johtaja ja saman koulun opettaja. Heidän keskusteluistaan käy selväksi, että Harryn velhojen vanhemmat tappavat tumma taikuri Voldemort, jonka nimeä kaikki pelkäävät lausua paitsi Dumbledore. Jostain syystä konna ei pystynyt tappamaan poikaa, Voldemort pystyi jättämään vain arven lapsen otsaan, samanlainen kuin salama. Ohjaaja päättää viedä Harryn Dursleyjen kynnykseen: täällä lapsi on turvassa.
Poika asuu kymmenen vuotta tätinsä ja setänsä kanssa. Hänellä ei ole lämpöä, kaikki huomio kohdistuu vertaispuolisoonsa, rasvaan hemmotteluun kuuluvaan poikaan, joka Harryn mukaan näyttää olevan sika peruukissa. Serkku lyö potterin, hän käyttää vanhoja vaatteita hänen perässään.
Serkkun syntymäpäivä on tulossa. Dursleyjen on vietävä Harry eläintarhaan poikansa ja hänen ystävänsä kanssa. Siellä tapahtuu jotain uskomatonta: Harry kääntyy käärmeen puoleen ja näyttää siltä, että hän ymmärtää häntä. Sitten lasi katoaa terraariumista, ja boa indeksoi ulos. Täti ja setä toteavat Harryn syyllistyneen tähän ja rankaisevat.
Jonkin ajan kuluttua Harrystä saapuu paljon identtisiä kirjeitä, mutta setänsä ei salli veljenpoikansa lukea niitä. Hän vie perheen kotaan kallion keskelle merta toivoen, että heitä ei löydy täältä. Mutta keskiyöllä, Harryn yhdestoista syntymäpäivänä, jättiläinen Hagrid ilmestyy mökkiin ja tuo pojalle kirjeen: Potter kutsutaan opiskelemaan Tylypahkaan.
Hagrid antaa Harrylle pöllön syntymäpäiväänsä - velhojen maailmassa he kuljettavat postia. Lisäksi jättiläinen ja poika ostavat kaiken taikuuden kouluun tarvittavan, ottavat jonkin kimppun ja rahaa Potterille, jonka vanhemmat olivat jättäneet pankista.
Junassa Harry ratsastaa Ron Weasleyn kanssa. Pojaista tulee heti ystäviä, ja ylimielisestä Malfoy Dracosta tulee heidän vihollisensa. Jo koulussa, Ronin ja Harryn ja Malfoy-jengin välillä käydään jatkuvasti yhteenottoja, kaverit rikkovat säännöllisesti koulusääntöjä ja menettävät pisteitä Gryffindor-tiedekunnalleen. Gryffindorin nörtti ja tylsä Hermione Granger tulee kerran vahingossa heidän yöllisen kävelykierroksensa jäseneksi. He tuskin onnistuvat olemaan huomaamatta. Hermione on järkyttynyt:
Meidät kaikki voidaan tappaa ... tai mikä vielä pahempaa, karkotettu koulusta.
Ensimmäisessä luudanharjan oppitunnissaan Harry lentää ilmaan rikkoen opettajansa kieltoa. Tämä johtuu siitä, että ilkeä Malfoy heitti Gryffindor-oppipoikan maagisen pallon korkealle. Potter onnistuu loistavasti saamaan pallon. Hänen temppu on huomannut yksi professoreista. Harry ajattelee jo karkotusta, mutta sen sijaan professori määrittelee hänet sieppojaksi Gryffindor Quidditch -joukkueessa - ottajan on ottelun aikana saatava kiinni lentävä pallo, jota on erittäin vaikea huomata.
Hermione nuhtelee Harryä ja Ronia rikkomuksista. Ron loukkaa vahingossa tyttöä sanomalla, että hänen ystäviensä poissaolo ei ole yllättävää. Hermione lähtee pitkään itkemään wc: hen. Tällä hetkellä kouluun ilmestyy jättiläinen peikko. Opiskelijoita käskettiin menemään asuntoloihin, mutta Hermionesta, Ronista ja Harrystä huolissaan kävellä häntä kohti. Tuossa siipissä he huomaavat professori Kalkaron, synkän ja epämiellyttävän opettajan, etenkin Harryn, joka ei pitänyt hänestä.Kaverit onnistuvat pelastamaan Hermionen pelasta, josta he saavat pisteitä tiedekunnasta. Hermione Grangeristä tulee heidän ystävänsä.
On tapahtuneita selviytyneitä tapahtumia, joista ei voi olla muuta kuin sympatiaa toisilleen. Ja voitto neljän metrin vuorijärjestyksestä viittaa epäilemättä tällaisiin tapahtumiin.
Harry saa selville, että päivänä, jolloin hän ilmestyi pankkiin ennen kouluvuoden alkua, yritettiin varastaa jotain erittäin arvokasta, mutta tallelokero oli tyhjä. Poika muistaa, että Hagrid otti sieltä jonkinlaisen paketin. Koulun ystävät löytävät huoneen, jossa hurja kolmipäinen koira suojaa luukkua: ilmeisesti siellä on kimppu. Lapset epäilevät, että Kalkari haluaa siepata hänet.
Ensimmäisessä kvidditch-ottelussa joku yrittää heittää Harry pois luudasta, mutta hän onnistuu tarttumaan palloon ja tuottamaan voiton Gryffindorille. Kaverit luulevat, että vihattu Kalkari haluaa tappaa Potterin.
Hagrid, keskustelussa paketista, tekee varauksen ja lausuu taikurin nimen, jota lapset tuntevat. Pitkän tutkimuksen jälkeen he saavat selville, että hän on filosofin kivin luoja. Joten Kalkarin tavoite on kivi.
Malfoy tietää, että Hagrid pitää vauva-lohikäärmettä, vaikka tämä on kielletty. Rona puree lohikäärmettä kädellä ja poika putoaa sairaalan siipiin. Harry ja Hermione päättävät siirtää vauvan Romaniaan veli Ronin ystävien kautta keskiyöllä koulun katolla. Siellä he kulkevat näkymättömyyden viitan alla, jonka Harry antoi tuntemattomalle jouluksi. Mutta lapset unohtavat hänet katolla, ja vihainen professori tarttuu heidän käytävään: hän on jo saanut Malfoyn kiinni. Hän uskoo, että Harry keksi lohikäärmetarinan provosoimaan Malfoya rikkomaan sääntöjä. Kaikki rikkojat saavat rangaistuksen: he viettävät yön kielletyssä metsässä, ja valtavat pisteet poistetaan tiedekunnistaan. Nyt Gryffindorista ei tule vuoden johtajaa. Kaikki opiskelijat lopettaa puhumisen Harryn kanssa suosioistaan huolimatta.
Metsässä Harry näkee omituisen olennon juomassa yksisarven verta. Pojalla alkaa olla kauhea arpi otsassa. Kentauri pelastaa Harryn kauheasta olennosta. Hän selittää, että vain ne, joissa ei ole mitään inhimillistä, juovat yksisarvisen veren. Pojan mielestä Voldemort on mukana tässä.
Harry kuulee toistuvasti Snapea uhkaavan professorin Quirellin, komistumisen. Ystävät uskovat, että Quirell sai tietää Kalkaron aikomuksesta varastaa kiven, mutta ei voi vastustaa sitä.
Ohjaaja Dumbledore lähtee kiireelliseen asiaan. Harry, Ron ja Hermione tuntevat ongelmia ja päättävät mennä luukkuun, missä filosofin kivi varastoidaan. Oppimalla Hagridilta, että koira pannaan nukkumaan musiikin avulla. Harry ja Hermione ottavat vuorotellen hankalasti ääniä huilusta ja kaverit hyppäävät luukkuun. He selviytyvät velhojen loitsuista, mutta vain yksi pääsee loppuun. Dungeonissa Harry tapaa Quirellin. Koko tämän ajan professori teeskenteli, Snape arvasi suunnitelmistaan. Se oli Quirell, joka yritti tappaa Harryn ottelun aikana, vapautti peikan ja joi yksisarven verta. Quirrell piilottaa Voldemortin kasvot pään takaosaan, jonka professori peitti turbanilla.
Potterin avulla hän haluaa saada kiven, mutta ei voi koskettaa poikaa: Quirell saa hirvittäviä palovammoja. Taistelun aikana Harry pyörtyi.
Herättyään koulussairaalassa, poika näkee Dumbledoren edessään: johtaja onnistui pelastamaan hänet. Professori selittää, että Potteria auttoi hänen äitinsä rakkaus, joka asuu nyt itse Harryssä. Rakkaus on sietämätöntä Quirellille ja Voldemortille, se poltti Quirellin lapsen kosketuksessa.
Rakkaus jättää jälkensä ... Jos sinua rakastetaan niin syvästi, vaikka sinut rakastava ihminen kuolee, pysyt silti hänen suojelunsa alla.
Harry oppii ohjaajalta, että hänen isänsä ja Kalkaronsa olivat vihollisia, mutta Potter pelasti kerran henkensä. Siksi Kalkaro yritti parhaansa mukaan pelastaa Harry Quirellistä, joten halusi palauttaa velan Potterille.
Filosoofin kivi tuhoaa sen kuusisataa vuotta vanha luoja. Poika on surullinen tästä uutisesta, koska kiven luoja kuolee. Dumbledore rauhoittaa:
Hyvin organisoidulle mielelle kuolema on toinen seikkailu.
Viimeisellä koulujuhlalla ystävät saavat suuria pisteitä hyväksikäytöstään, ja Gryffindorista tulee vuoden johtaja.