Maaliskuu 1865. Yhdysvalloissa sisällissodan aikana viisi koveta pohjoista pakenivat Richmondista, jonka eteläiset valtasivat ilmapalloina. Kauhea myrsky heittää neljä heistä asumattoman saaren rannalle eteläisellä pallonpuoliskolla. Viides mies ja hänen koiransa ovat piilossa meressä rannikon edustalla. Tämä viidesosa - tietty Cyres Smith, lahjakas insinööri ja tiedemies, sielu ja matkustajien ryhmän johtaja - pitää tietämättään seuralaisiaan jännityksessä useita päiviä, joista ei missään tapauksessa löydy häntä tai hänelle omistautunutta koiraa. Entinen orja kärsii eniten, ja Smithin nyt uskollinen palvelija on Negro Nab. Ilmapalloissa oli myös sotatoimittaja ja Smithin ystävä, Gideon Spilet, erittäin energinen ja päättäväinen mies, jolla oli kutiseva mieli; merimies Pencrof, hyväntuulinen ja seikkailunhaluinen tyttö; Viisitoistavuotias Harbert Brown, sen laivan kapteenin poika, jolla Pencrof purjehti, pysyi orvona ja jolle merimies kohtelee omaa poikaansa. Väsyttävän etsinnän jälkeen Nab löytää lopulta selittämättömästi pelastetun isäntänsä, mailin päässä rannikosta. Jokaisella saaren uudella asuttajalla on korvaamattomat kyvyt, ja Cyresin ja Spiletin johdolla nämä rohkeat ihmiset kokoontuvat ja muodostavat yhtenäisen joukkueen. Ensinnäkin, siirtomaalaiset varustavat elämänsä yksinkertaisten käsillä olevien keinojen avulla, sitten tuottamalla omissa pienissä tehtaissaan yhä monimutkaisempia työ- ja taloustavaroita. He metsästävät, keräävät syötäviä kasveja, ostereita ja sitten jalostavat kotieläimiä ja harjoittavat viljelyä. He järjestävät asumisen itselleen korkealla kalliossa, vedestä vapaassa luolassa. Pian työstönsä ja älykkyyden ansiosta siirtomaalaiset eivät enää tiedä ruuan, vaatteiden, lämmön ja mukavuuden tarvetta. Heillä on kaikkea muuta kuin kotimaansa uutisia, joiden kohtalosta he ovat erittäin huolissaan.

Palattuaan takaisin asuntoonsa, jota he kutsuvat Graniitti Palatsiksi, he näkevät, että apinat ovat pommittelemassa sisäpuolella. Jonkin ajan kuluttua, kuin hullu pelon vaikutelmassa, apinat alkavat hypätä ulos ikkunoista ja jonkun käsi heittää köyden tikkaat, jotka apinat nostivat taloon. Sisältä ihmiset löytävät toisen apinan - orangutanin, jota he pitävät ja kutsuvat Jupe-setäksi. Tulevaisuudessa Jupesta tulee ystävä, palvelija ja välttämätön auttaja ihmisille.

Toisena päivänä asukkaat löytävät hiekasta laatikon, jossa on työkaluja, ampuma-aseita, erilaisia ​​laitteita, vaatteita, keittiövälineitä ja englanninkielisiä kirjoja. Settlers ihmettelevät, mistä tämä laatikko voisi tulla. Kartasta, joka myös esiintyi laatikossa, he huomaavat, että heidän saarensa vieressä, kartalla, jota ei ole merkitty, on Taborin saari. Merimies Pencrof haluaa mennä hänen luokseen. Ystäviensä avulla hän rakentaa robotin. Kun botti on valmis, he kaikki yhdessä lähtevät kokeilemaan matkaa saaren ympäri. Sen aikana he löytävät pullon, jossa on merkintä siitä, että haaksirikkoutunut ihminen odottaa pelastusta Taborin saarella. Tämä tapahtuma vahvistaa Pencroffin luottamusta vierailla naapurisaarella. Pencrof, toimittaja Gideon Spilet ja Harbert purjehtivat. Taboriin saapuessaan he havaitsevat pienen hökkelin, jossa kukaan ei viipymättä ole asunut pitkään. He hajoavat saaren ympäri, toivomatta nähdä elävää ihmistä ja yrittävät löytää ainakin hänen jäänteensä. Yhtäkkiä he kuulevat Harbertin huudon ja rynnättävät apuaan. He näkevät Harbertin kamppailevan jonkinlaisen apinoilla kasvatetun olennon kanssa. Apina osoittautuu kuitenkin villiksi mieheksi. Matkustajat sitovat hänet ja kuljettavat hänet saarelleen. He antavat hänelle erillisen huoneen graniittipalatsissa. Heidän huomionsa ja huolenaiheidensa ansiosta villi muuttuu pian takaisin sivistyneeksi ihmiseksi ja kertoo heille tarinansa. Osoittautuu, että hänen nimensä on Ayrton, hän on entinen rikollinen, hän halusi ottaa haltuunsa Duncan-purjealuksen ja muuttui samojen yhteiskuntien avulla merirosvolaivaksi. Hänen suunnitelmiensa ei kuitenkaan ollut tarkoitus toteutuvan, ja rangaistuksena 12 vuotta sitten hänet jätettiin asumattomalle Taborin saarelle, jotta hän ymmärtäisi tekonsa ja sovittaisi syntinsä. "Duncan" -omistaja Eduard Glenarvan kuitenkin sanoi, että jonain päivänä hän palaa Ayrtoniin. Uudisasukkaat näkevät, että Ayrton katuu vilpittömästi menneisyydestään ja yrittää olla heille hyödyllinen kaikin tavoin. Siksi he eivät ole taipuvaisia ​​tuomitsemaan häntä aikaisemmista väärinkäytöksistä ja ottamaan hänet mielellään vastaan ​​heidän yhteiskunnassaan. Ayrton tarvitsee kuitenkin aikaa, ja siksi hän pyytää mahdollisuutta elää korallissa, jonka uudisasukkaat rakensivat kotieläimilleen jonkin matkan Graniitti Palatsista.

Kun botti palasi myrskyyn Taborin saarelta yöllä, se pelasti nuotion, jonka heidän ystävänsä sytyttivät heidän mielestään kelluessaan siihen. Osoittautuu kuitenkin, etteivät he olleet mukana tässä. On myös käynyt ilmi, että Ayrton ei heittänyt pullon seteliä mereen. Settlers ei voi selittää näitä salaperäisiä tapahtumia. He ovat yhä enemmän taipuvaisia ​​ajatukseen, että heidän lisäksi Lincolnin saarella kastettaessa häntä on joku muu, heidän salaperäinen hyväntekijä, joka usein auttaa heitä vaikeimmissa tilanteissa. He jopa aloittavat etsintämatkan toivoen löytävänsä asuinpaikan. Haku kuitenkin päättyy turhaan.

Seuraavana kesänä (koska Ayrton esiintyi heidän saarellaan ja ennen kuin hän kertoi heille tarinansa, viisi kuukautta on jo kulunut ja kesä on ohi, ja kylmäkaudella on vaarallista purjehtia), he päättävät palata takaisin Tabor-saaret jättävät nuotin koteloon. Muistiinpanossa he aikovat varoittaa kapteenia Glenarvania, jos hän palaa, että Ayrton ja viisi muuta onnettomuuden uhria odottavat apua naapurisaarella.

Asuttajat ovat asuneet saarella kolmen vuoden ajan. Heidän elämänsä, taloutensa ovat saavuttaneet vaurauden. He korjaavat jo yhden viljan viljelyssä rikkaita vehnäkasveja, jotka löydettiin Harbertin taskusta kolme vuotta sitten, rakensivat myllyn, kasvattivat siipikarjan, varustivat asunnon täysin, tekivät itselleen uusia lämpimiä vaatteita ja huopia muflonvillasta. Heidän rauhallista elämäänsä varjoaa kuitenkin yksi tapaus, joka uhkaa heitä kuolemalla. Kerran he katsovat merelle katsoen etäisyydestä hyvin varustetun aluksen, mutta laivan yläpuolella lepää musta lippu. Alus ankkuroi rannikon ulkopuolelle. Se näyttää kauniita pitkän kantaman aseita. Ayrton hiipii alukseen yön varjolla suorittaaksesi tiedustelua. Osoittautuu, että aluksella on viisikymmentä merirosvoa. Ihmeellisesti liukumassa heiltä, ​​Ayrton palaa rantaan ja ilmoittaa ystävilleen, että heidän on valmistauduttava taisteluun. Seuraavana aamuna kaksi venettä laskeutuu aluksesta. Ensimmäisenä, siirtokunnat ampuvat kolme, ja hän palaa, toinen laskeutuu rannalle, ja kuusi jäljellä olevaa merirosvoa piiloutuvat metsään. Tykit ovat poltettu aluksesta, ja se tulee vielä lähempänä rantaa. Vaikuttaa siltä, ​​että missään ei ole voimaa pelastaa kourallinen uudessa asukkaista. Yhtäkkiä laivan alla nousee valtava aalto, ja se uppoaa. Kaikki siinä olevat merirosvot kuolevat. Kuten myöhemmin käy ilmi, kaivoksen räjäyttivät aluksen, ja tämä tapahtuma vakuuttaa lopulta saaren asukkaat, etteivät he ole yksin täällä.

Aluksi he eivät aio tuhota merirosvoja, vaan haluavat antaa heille mahdollisuuden elää rauhallista elämää. Mutta käy ilmi, että ryöstö ei ole kykenevä tähän. He alkavat ryöstää ja polttaa uudisasukkaiden kotitalouksia. Ayrton menee korallin luokse käymään eläimiä. Merirosvot tartuttavat hänet ja vievät hänet luolaan, missä he haluavat kiduttaa häntä saadakseen suostumuksen mennä heidän puolelleen. Ayrton ei anna periksi. Hänen ystävänsä auttavat häntä, mutta loukkaantuvat vakavasti Harbertin korallissa, ja hänen ystävänsä pysyvät hänessä, eivätkä voi mennä takaisin kuolleen nuoren miehen kanssa. Muutaman päivän kuluttua he lähtevät silti Graniitti Palatsiin. Siirtymisen seurauksena Harbertille alkaa pahanlaatuinen kuume, hän on kuolemassa. Jälleen kerran, providence puuttuu heidän elämäänsä ja heidän hyvän salaperäisen ystävänsä käsi heittää heille tarvittavat lääkkeet. Harbert on toipumassa täysin. Uudisasukkaat aikovat antaa viimeisen iskun merirosvoille. He menevät koralliin, missä he aikovat löytää heidät, mutta he löytävät Ayrtonin, joka on uupunut ja tuskin elossa, ja lähistöllä ryöstäjien ruumiit. Ayrton kertoo, että hän ei tiedä miten hän päätyi koralliin, joka toi hänet luolasta ja tappoi merirosvot. Hän ilmoittaa kuitenkin yhden surullisen uutisen. Viikko sitten rosvot menivät merelle, mutta tietämättä kuinka hallita botti, rikkoivat sen rannikkiriuttoilla. Matka Taboriin on siirrettävä uuden ajoneuvon rakentamiseen saakka. Seuraavan seitsemän kuukauden aikana salaperäinen muukalainen ei tunne itseään. Sillä välin saarella herää tulivuori, jonka siirtolaisten mielestä oli jo kuollut. He rakentavat uutta suurta alusta, joka tarvittaessa voisi viedä heidät asutulle maalle.

Yhtenä iltana, jo valmistuessaan menemään nukkumaan, Graniitti Palatsin asukkaat kuulevat kellon. Siirto, jonka he viettivät korallista kotiinsa, toimii. Heidät kutsutaan pikaisesti koralliin. Sieltä he löytävät huomautuksen, jossa heitä pyydetään menemään ylimääräistä johtoa pitkin. Kaapeli johtaa heidät valtavaan luolaan, jossa hämmästyksekseen he näkevät sukellusveneen. Siinä he tutustuvat sen päällikön ja hänen suojelijansa, kapteenin Nemo, intialaisen prinssin Dakkarin kanssa, joka on koko elämänsä taistellut kotimaansa itsenäisyydestä. Hän, jo kuusikymmentävuotias mies, joka haudatti kaikki kumppaninsa, on lähellä kuolemaa. Nemo antaa uusille ystäville arkkuja koruilla ja varoittaa, että tulivuoren purkautuessa saari (sellainen on sen rakenne) räjähtää. Hän kuolee, uudisasukkaat kääntävät veneen luukut ylös ja laskevat sen veden alla, ja he rakentavat uutta alusta väsymättä koko päivän. Heillä ei ole kuitenkaan aikaa lopettaa sitä. Kaikki elämä menehtyy saaren räjähdyksen aikana, josta jää vain pieni valtameri. Asukkaita, jotka viettivät yön teltassa rannalla, heittää mereen ilma-aalto. Ne kaikki, Jupea lukuun ottamatta, pysyvät hengissä. Yli kymmenen päivän ajan he ovat istuneet riutalla, melkein kuolleet nälkään eivätkä enää usko mihinkään. Yhtäkkiä he näkevät laivan. Tämä on Duncan. Hän pelastaa kaikki. Kuten myöhemmin käy ilmi, kapteeni Nemo, kun robotti oli vielä ehjä, leijui sen päälle Taborille ja jätti muistiinpanon pelastajille.

Palattuaan Amerikkaan kapteenin Nemo lahjoittamien korujen takia, ystävät ostavat suuren osan maata ja asuvat siinä samalla tavalla kuin he asuivat Lincolnin saarella.